Yalnız lise öğrencisi Yukiteru Amano, günlerini cep telefonuna günlük yazarak, zaman ve uzay tanrısı Deus Ex Machina ile onun hizmetkarı Murmur adındaki görünüşte hayali iki arkadaşıyla sohbet ederek geçirir. Gerçek bir varlık olduğunu açığa vuran Deus, Yukiteru'ya geleceğe dair son derece ayrıntılı girdiler gösteren "Random Diary" adlı bir günlük verir ve onu, benzer güçte geleceğin günlüğüne sahip 11 diğer kişiyle kanlı bir ölüm kalım savaşına sürükler.